La pequeña Mary Lennox (Kate Maberly) acaba de sufrir una terrible tragedia, pues sus padres murieron a causa de un devastador terremoto en la India. Ahora Mary debe dirigirse a Yorkshire, Londres, lugar en donde vive su pariente más cercano y ahora representante, su tío Lord Archibald Craven (John Lynch).

Acostumbrada a no ser tomada muy en serio, Mary no verá demasiados cambios cuando llega al gótico castillo de Lord Archibald, ya que este no le presta ni la menor atención, pues todavía está de duelo por la muerte de su esposa hace 10 años atrás. Ahora Mary quedará al cuidado de la minuciosa y malhumorada ama de llaves, Sra. Medlock (Maggie Smith), quien le tiene terminantemente prohibido deambular sin supervisión adulta.

Sin embargo, y muy a pesar de las prohibiciones de la Sra. Medlock, Mary hará dos grandes descubrimientos durante su estadía en el castillo. La primera, que tiene un primo: Colin, que está muy enfermo y a quien no le permiten salir del castillo. Y la segunda, un hermoso jardín secreto que permanecía bajo llave y que por falta de cuidados se está secando.

Ahora Mary se pondrá la misión de restaurar el hermoso jardín que una vez se convirtió en el lugar favorito de su difunta tía y así buscar una manera de reavivar el amor dentro de esta familia que la tristeza y la falta de comunicación han llevado a menos.